2020-04-08

研究者が、致命的なコロナウイルスに3つの亜種を発見。

研究調査開発健康

香港の英字新聞「SCMP(South China Morning Post/サウス・チャイナ・モーニング・ポスト/南华早报/南華早報)」は2020年04月11日に、イギリスとドイツの遺伝学者の報告によると、タイプA、B、Cはすべてコウモリで最初に見つかった病原体に由来するが、異なる方法で進化したと伝えている。

中国の疫学者によると、ウイルスが拡散すると、ウイルスは人間の感染によく適応し、変異する。

イギリスとドイツの遺伝学者は、「Covid-19」を引き起こすコロナウイルスの進化経路をマッピングし、現在世界中に3つのバージョンのウイルスが蔓延していると判断したと報告した。

亜種(variants/バリアント)がどのようにして形成され、その後広まったかを発見することは、科学者がその起源を特定し、なぜそれがそれほど伝染性であるかを説明するのに役立つ。

研究者らは、2019年12月24日から2020年03月04日の間に、ヒト患者からシーケンシングされた最初の160の完全なウイルスゲノムを分析し、変異を通じて「Covid-19」のヒトにおける初期進化経路を再構築した。

ケンブリッジ大学の遺伝学者で研究の筆頭著者であるピーター・フォースター(Peter Forster, a geneticist at University of Cambridge and lead author of the study)は、「急速な変異が多すぎて、『Covid-19』家系をきちんと追跡でき無かった。そこで、数学的ネットワークアルゴリズムを使用して、もっともらしいツリーすべてを同時に視覚化した。」と、言った。

Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes

Peter Forster,
Lucy Forster,
Colin Renfrew, and
View ORCID ProfileMichael Forster
PNAS first published April 8, 2020
https://doi.org/10.1073/pnas.2004999117
Contributed by Colin Renfrew, March 30, 2020 (sent for review March 17, 2020; reviewed by Toomas Kivisild and Carol Stocking)

「これらの手法は、先史時代の人間集団の動きをDNAでマッピングすることでよく知られている。これは、『Covid-19』のようなコロナ・ウイルスの感染経路を追跡するために使用された最初の例の1つだと考えられる。」彼は大学のWebサイト上の研究報告で言った。

亜種タイプAは、コウモリで発見されたコロナウイルスに最も近く、最初の発生の震源地である中央中国の都市武漢(Wuhan)で発見されたが、そこでの主要なタイプではなかったと、彼らは言った。

亜種タイプAは、武漢に住んでいたアメリカ人、および米国とオーストラリアで診断された他の患者でも見られた。

武漢で見つかった最も一般的な亜種タイプBだったと研究は述べたが、これは変異する前に東アジアをはるかに超えて移動しなかったようだと研究者たちは言った。

最後に、亜種タイプCは、フランス、イタリア、スウェーデン、イギリスのケースに基づいて、ヨーロッパで最も頻繁に見られる亜種であった。 この研究によると、シンガポール、香港、韓国のサンプルからは検出されたが、中国本土の患者では検出されなかった。

研究者たちは、亜種タイプAがコウモリとセンザンコウで発見されたウイルスに最も密接に関連していたため、アウトブレイクの原因となったと結論付けた。

亜種タイプBは2つの変異によって分離された亜種タイプAから派生したものであり、亜種タイプCは亜種タイプBの「娘」であった。

ピーター・フォースターは、「武漢タイプB型ウイルスは、免疫学的または環境的に東アジアの人口の大部分に適応する可能性がある。」「この初期の段階では、東アジアの突然変異率が他の地域よりも遅いようで、東アジア外の抵抗を克服するために突然変異させる必要があるかもしれない。」と述べた。

また、人々の行動が、ウイルスの蔓延をどのように助けたかを記録した。

たとえば、調査では、2020年02月28日に診断されたメキシコ人旅行者で発見された、イタリアへのウイルスで最も早い導入の1つが、最初に文書化されたミュンヘンの会社で働いていたドイツ人によって、2020年01月27日にドイツへの感染が行われたことを示唆した。

そのドイツ人は、武漢から最近訪問した両親から感染した上海の中国人の同僚から感染した。

研究者たちは武漢からメキシコへのウイルスの旅における10の変異亜種を記録した。

フォースターは、「私たちは人のウイルスの「家系図」(進化の歴史)を再構築したので、このツリーを使用して、ある人間から次の人間への感染経路を追跡でき、ウイルスで試みたときに将来の感染を抑制する統計ツールに戻ることができる。」とフォースターは言った。

つまり、考古学で開発されたDNA追跡ツールが、ウイルスの感染経路の解析に利用できた。

そういえば、以前、香港の英字新聞「SCMP(South China Morning Post/サウス・チャイナ・モーニング・ポスト/南华早报/南華早報)」で、亜種の増え方をインフォグラフィクスで紹介していた。

研究者はデータで、いつ発生が始まったかをよりよく判断できると彼は付け加えた。

「起源と広がりに関するこの改善された知識により、より正確なコンピューターシミュレーションで、どの対策が最も効果的かを予測できるようになることを願っています」と彼は言った。

そういえば、日本でも数理科学で、感染を抑えるといい、それを「COVID-19」の「第2の震源地を作った」日本の責任者加藤勝信厚生労働大臣が、鸚鵡返しで感染抑制に利用すると言っていたが、その数理科学も、より正確なコンピューターシミュレーションで、どの対策が最も効果的かを予測できるようになることで、役立つかもしれないが、基礎知識が無くて、先に数理科学だけで感染を抑えることより有意義である。

先走りは、混乱を招く!

広東省の首都広州にある孫文が創立した中山大学(孫逸仙大学)の疫学者嘉海呂(Lu Jiahai, an epidemiologist at Sun Yat-sen University Guangzhou)は、この研究はゲノミクスと分子変動の予備分析を提供したと語った。

彼は。「ウイルスは、拡散の間に変異し、異なる国からの異なる集団の人間の間での伝染で、さらに適応するようになりました。」と言った。

しかし、亜種は互いに関連していたので、異なるグループ内の変異を追跡することはウイルスの起源を特定するのに役立つ可能性があると彼は言った。

さらに嘉海呂は「この研究は、ウイルスの蔓延がさまざまな集団にますます適応しているため、パンデミックに真剣に取り組む必要があることを示しています.」と述べている。


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